Bachelor- und Masterarbeiten (für Informatik-Studierende)
In meiner Arbeitsgruppe können Bachelor- und Masterarbeiten im Fach Informatik in den folgenden Themenbereichen belegt werden:
- • IT-Sicherheit; insbes. zur Absicherung bioinformatischer
und biomedizinischer Anwendungen
(Referenz-Implementierungen) - Zusammenarbeit mit AG Katzenbeisser (CASED)
- • Scientific Computing; Algorithmenentwicklung
und massiv-parallele Ansätze für Simulation und Numerik
(Referenz-Implementierungen)
- GPU Implementierungen - mit der AG Goesele (IGD, GRIS)
- FPGA Implementierungen - mit der AG Koch
- und im Bereich der Optimierung
- • Lernbarkeit und Komplexität;
hier geht es um theoretische Informatik: biologisches
Systeme verarbeiten Information massiv-parallel und verteilt, sie speichern
sie über lange Zeiträume (dank Evolution) und sie können sie replizieren und
wiederverwenden - beweisen Sie es!
(theo. Arbeiten, Beweise, etc.)
- • Informationstheorie;
Information ist der Kern der Informatik und der Biologie.
Während die Mechanismen für die Akquise der Information meistens unterschiedlich
sind (rational designed in CS, evolviert in Bio), so treffen sich doch
beide Disziplinen in der Schnittmenge der Informationstheorie. Hier können
Sie uns helfen, Aspekte der Informationstheorie, ihrer Simulation und Auswertung
besser umzusetzen
(analytische Arbeiten mit Referenz-Implementierungen)
- • Machinelles Lernen, Robotik, und Evolution;
implementieren Sie Evolution für einen
Bodenroboter
und schauen Sie, wie er lernt
(Programmieren, Experimente)
Info
In der Arbeitsgruppe Computational Biology
können reguläre BSc- und MSc-Thesis
des Fachbereichs Informatik durch meine Zweitmitgliedschaft
im Fachbereich Informatik geschrieben werden. Es gibt eine
große thematische und methodische Übereinstimmung zu anderen
Arbeitsgruppen (insbes. Katzenbeisser, Goesele, Koch, Fellner, Roth),
so daß hier viele
Möglichkeiten zur gemeinsamen Arbeit gegeben sind.
Schreiben Sie mir einfach eine Email : hamacher(AT)bio(dot)tu-darmstadt(dot)de
Schreiben Sie mir einfach eine Email : hamacher(AT)bio(dot)tu-darmstadt(dot)de
News
- [13|05|12] Paper accepted in PLoS One on the molecular piracy hypothesis in plant virus genomes
- [10|04|12] Paper accepted in the 3rd International Emerging Computational Methods for the Life Sciences Workshop (ECMLS 2012) on massively-parallel Mutual Information computation on GPUs (CoMIC)
- [27|02|12] Workshop on Bitcoin accepted at the 42. Annual Meeting of the Gesellschaft für Informatik e.V.
- [19|02|12] Paper on DNA structure in algae virus published in PLoS One
- [23|01|12] Interview in der Kulturzeit auf 3sat. Abspielen in der 3sat-Mediathek.
- [14|01|12] Artikel in der Süddeutschen Zeitung über Julian Assange online
- [12|01|12] DFG grant application on K ion channels successfull
- [04|01|12] Feuilleton-Artikel in der Süddeutschen Zeitung erschienen über WikiLeaks/Julian Assange, basierend auf 28C3-Vortrag (PDF)
- [03|01|12] Videos available on my 28C3-talks on Julian Assange and on Bitcoin
- [30|12|11] Radio-Interview (Deutschlandfunk, MP3) on Bitcoin research available
- [30|12|11] 28C3-Paper (PDF) on Leaking and Systems Modelling available
- [10|12|11] Paper in PLoS One accepted on the structural organization of DNA in plant viruses
- [09|11|11] Paper on an Information Theoretical Dissection of the Holobiont was accepted in Nova Acta Leopoldina
- [06|09|11] Our paper on glycolysis was selected for the Virtual Journal of Biological Physics Research
- [08|08|11] Our paper on glycolysis was discussed in a viewpoint article in Physics(APS)
- [20|07|11] Paper accepted in Proteins on the biophys. annotation of molecular coevolution of acetylcholinesterase